qmail-popupやqmail-pop3dは何のログも出しません。
qmail-smtpdも。

smtpで出ているログは、tcpserverに-vを与えた時に出るログでしょう。

> うーん、何が原因なんですかね。

pop3の方でもtcpserverに-vオプションを与えてみてはいかが?
(smtpの方にだけついてますよ。)

                                前田敦司