ストーリー:
中学1年生の少女・鈴原みさきは, 運動音痴で体格も小さいのがコンプレックス。東京に来て早速人混みに飲まれてしまったみさきは, 目にした巨大モニターの映像に大きなショックを受ける。そこに映っていたのは, 「エンジェリックレイヤー」と呼ばれるバトルゲームの中継。「エンジェル(天使)」と呼ばれる思念操作型の人形同士を戦わせるゲームで, 白い天使が自分より大型の天使に対し一歩も譲らず華麗に勝利を収めたのだった。
一目でこのゲームに魅せられたみさき。そこに突然湧いて出た白衣の怪しいおじさん「いっちゃん」が手解きをし, みさきも「エンジェリックレイヤー」に参加することになった。大会での戦い, ライバルや親友との出会いを経て, みさきの行く先に待つものは……