ディスククラッシュの憂き目にあい、苦労して書いた設定ファイルもぶっとんで
しまいました。
書き直したものをバックアップがてら投稿します。
ツッコミどころ満載だと思いますが、好きにしてください。

GNOME 2.20
xmodmap に食わせるファイル。
これを ~/.xmodmaprc というファイル名で置いておくと、gnome は初回起動時、
そのファイルを読むかというダイアログを出す。
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keycode 49 = Escape
keycode  9 = Zenkaku_Hankaku
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"A" の隣は Cntl, "1" の隣は ESC でないとだめだめなもので。
Cntl <-> CapsLock の交換は、gnome-keyboard-properties
のボタンでおこなっている。