竹洞です。

> make xconfig で現れる configuration の選択欄に Pen4/Xeon
> はありますが、64 bit の選択肢がありません。
> で、インストールできるのかどうかが心配になってしまいました。

Processor type and featuresの項目に
Opteron/Athlon64/Hammer/K8
の選択肢があります。
(kernel 2.6.9)
これではダメですか？Itanium対応じゃないとダメとか？

こちらにIA64用のパッチがあります。2.6.9用はまだないんですが。
（マージされたのかな？そのあたり、詳しくないので）
http://www.kernel.org/pub/linux/kernel/ports/ia64/v2.6/
IntelのWebページのポインタはこちら
http://www.intel.com/design/itanium/hardware/linux_info.htm