こんばんは、

> Java の keytool で作った秘密鍵の方を取出したいのですが、どう
> したらいいでしょうか。

こちらは分かりません(調べた範囲では無かったと思うのですが...)。

> openssl の方で作った秘密鍵を Java の keystore に突っ込んでも
> いいんでしょうね。そちらの方法も、存在すれば教えて下さい。証
> 明書の方は、keytool -import で取り込めます。

秘密鍵単体ではないですが、J2EE SDKのkeytoolにopenssl等で作成した
PKCS12形式の証明書をjks形式のkeystoreへコンバートする機能があります。

参考にしたのは以下のページです：
http://java.sun.com/j2ee/sdk_1.3/ja/techdocs/release/ConfigGuide.html

# 意図していることと違うようでしたらすいません